۱- دسترسی به اطلاعات کاربران: استفاده از اپلیکیشنهای داخلی موجب بهخطرافتادن بیشتر اطلاعات کاربران میشود، زیرا حکومت ممکن است از طریق این ابزارها به آن اطلاعات دسترسی پیدا کند.
۲- ویروسها و نرمافزارهای مخرب: در نسخه اپلیکیشن این سرویسها خطر ورود ویروسها و ابزارهای مخرب بیشتر است تا نسخههای وب، و این اطلاعات حساس کاربران را تهدید میکند.
۳_ پشتیبانی و بهروزرسانی: نسخه وب معمولا بهروزرسانیهای سریعتر و موثرتری دریافت میکند، در حالی که نسخه اپلیکیشن ممکن است به دلیل محدودیتهای فنی و سیاستهای شرکتی، بهروزرسانیهای مکرر دریافت نکند.